甲沟炎初起未成脓时，局部可选用鱼石脂软膏、金黄散糊等敷贴或超短波、红外线等理疗，适当应用抗菌药。已成脓时，除了用抗菌药，应行手术处理。对单侧的皮下脓肿，可在甲沟旁切开引流；双侧皮下脓肿则需双侧引流。感染已累及指甲基部皮下周围时，可在两侧甲沟各作纵行切口，将甲根上皮片翻起，整理切除指甲根部，置一小片凡士林纱布或乳胶片引流。如甲床下已积脓，应将指甲拔去，或将脓腔上的指甲剪去。拔甲时，应注意避免损伤甲床，以免日后新生指甲发生畸形。
嵌甲性甲沟炎要用到手术治疗。例如：全甲拔除，经指根神经阻滞麻醉后拔除全甲，然后隔天换药，恢复时间长，较痛苦，渗出多，复发率高达60~80%。
缩窄甲根也是一种有效的手术治疗，甲后皱襞楔形切除：指根神经阻滞麻醉后，用无齿镊的一脚分离甲侧缘与甲床，用尖剪从甲前缘向甲根剪去潜入甲沟部分的甲板，至甲角时，将延续于其后的甲上皮、甲皱顶楔形切除一小块，拔出甲板边缘，开放脓腔，并用刀刮除缺口下的甲母质，不留碎片，以达到缩窄甲根，切开引流的目的。术毕用3%双氧水及生理盐水冲洗后将0.5%碘伏棉球塞入甲沟中，次日拔除。
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