一、子宫异常
子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响。内环境就是子宫内膜，太薄、太厚都会影响着床。由于子宫缺陷引起的流产约占10%~15%，常见的有：
1、先天性苗勒氏管的异常。包括单角子宫、双子宫及双角子宫致宫腔狭小，血供受到限制，子宫动脉发育异常可导致蜕膜化不同步和种植异常。
2、宫腔粘连。主要由宫腔创伤、感染或胎盘组织残留后引起宫腔粘连及纤维化，阻碍了正常蜕膜化和胎盘种植。
3、子宫肌瘤及子宫内膜异位症引起血供减少导致缺血和静脉扩张，蜕膜化不同步，种植异常以及肌瘤造成的激素改变也会引起妊娠的失败。
4、先天性或损伤性宫颈内口松弛以及胎内接受乙烯雌酚治疗致宫颈发育异常常致中期妊娠流产。
二、生殖道感染：
除以上各种因素外，感染所致孕早期流产愈来愈受到国内外学者的重视，妊娠早期严重的TDRCH感染可引起胚胎死亡或流产，较轻感染亦可引起胚胎畸形；研究表明巨细胞病毒可引起过期流产、胎死宫内等。母体发生感染后病原体可通过血行使胎盘感染，引起绒毛膜和毛细血管内皮受损，破坏胎盘屏障，病原体进入胎儿导致流产、胚胎停止发育及胎儿畸形图。近年来许多研究表明支原体感染与胚胎停止发育有关，胚胎停止发育妇女宫颈分泌物支原体感染阳性率明显高于正常妇女，并有极显著差异。