首先要有高度的责任心和严肃的科学态度。头痛症的临床检查比较复杂，如果医生一听到头痛的主诉就感到烦恼，有怕麻烦的思想，检查起来，就可能粗枝大叶，处理草率，造成误诊和漏诊。因此，医生首要的是要有高度的责任感，以认真的科学态度详细查体。尤其是屈光不正和眼肌疲劳的检查比较复杂，比如混合性散光，容易出现误差；但无论轴向（散光）或度数都要求很严格，即是误差较小也能明显地影响效果。因此，需要认真细心地检查，不能轻易认为头痛与眼无关，以免漏诊。其他如内耳、前庭神经功能、X光照像以及脑血管造影等脑系神经科特殊项目，也要根据需要作必要的检查。
此外应根据病史线索，有重点的进行检查。如果头痛明显与用眼有关，就应当首先考虑眼的检查。如果头痛有明显的时间性，又有鼻子通气不畅，嗅觉减退等病史，首先应当考虑到鼻部和鼻副窦的检查。而神经衰弱患者，却往往主诉漫无边际，无所主次，症状繁多：头痛性质为隐隐作痛，时轻时重，时好时发，伴有头晕、失眠、焦虑和精神不振等等。但也应当对功能性头痛和某些严重器质性疾病的兼症加以区别，比如更年期综合症和内脏肿瘤，都可能有慢性头痛史。并注意鼻咽腔恶性肿瘤和一般鼻部疾病引起的头痛，以及脑瘤和偏头痛的鉴别等，以免误诊延误病情。