细菌感染
如果是吃了类似于有严重细菌感染的食物中毒之后，最大的后遗症就是会使得患者的肠胃长期处在细菌感染的状态下，会出现长期腹胀腹泻等症状，如果这些细菌没有得到及时的根除，甚至还会使得患者出现胃部溃疡或者是消化道溃疡。所以食物中毒有所好转之后，详细的身体检查也是必不可少的。
内分泌紊乱
孩子食物中毒之后会对神经中枢系统造成损伤，尤其是吃一些有毒的蘑菇之后，对于神经和中枢系统的这种破坏性是无法逆转的，因此即便是患者没有出现神志不清或者是没有出现呕吐等症状，但是患者的被破坏的神经系统是没有办法恢复的，所以在一段时间内，患者也许会出现面部神经失调或者是内分泌紊乱的症状。
肾脏损伤
孩子食物中毒之后会对身体的其他系统也造成一定的损伤，比如泌尿系统和肾脏，因为肾脏是对这些毒素进行代谢的，如果毒素太多的话，很有可能会造成肾脏内有一定的残留，对肾脏也会造成损伤。
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