衣原体是一种介于细菌和病毒之间寄生于细胞内的病原体。衣原体呈阳性时不能怀孕，以免引起流产。支原体和衣原体是可以在正常人体内寄生的。它们和体内其他微生物相互制约达到一种平衡，使得相互的数量受到控制不至于对人体造成影响。是否需要治疗，医生除了参考检验结果还要结合症状和体征，如果不需要治疗而滥用抗生素，会破坏原有的“菌群平衡”，反而会使病原微生物的数量增加而发病。如果是孕早期支原体感染，有引起胎儿畸形的可能。
目前没有什么有效的治疗方法。衣原体、支原体因为它能进入宫腔，进入女性宫腔里，所以它对孕期的怀孕妇女还是有一定的影响，对胎儿是有一定影响，一般建议治好了以后再怀孕。衣原体感染途径：衣原体可以通过性传播，也可以通过呼吸道传播，其中母婴传播是沙眼衣原体的一种传播方式。孕妇生殖道感染沙眼衣原体后，阴道分娩时60%～7 0%的新生儿有被感染的危险，引起新生儿结膜炎、肺炎、中耳炎、女婴阴道炎等，新生儿眼结膜炎的发病率最高。
另外，沙眼衣原体感染还可能引起流产、宫内死胎及新生儿死亡。因此，为了避免危害胎儿，孕妇如发现有生殖道沙眼衣原体感染，应该积极治疗。如果没有症状不需治疗，有40%的人是衣原体的正常携带者。衣原体、支原体感染，如果是生殖道感染并在发病期容易导致流产，如果是呼吸道感染就没太大影响。