1、穿琥宁：该药连续使用超过1周或药物过量，将可能出现血小板下降。临床特别是儿科应用时需注意。
2、利巴韦林，新博林（三氮唑核苷)：该药有较强的致畸作用，但无致癌作用。体内消除慢，停药4周尚不能完全自体内消除。孕妇及有可能怀孕的妇女禁用。大剂量应用（包括滴鼻)可致心脏损害，对有呼吸道疾患者可致呼吸困难，胸痛等。慢性阻塞性肺病或哮喘者需注意。
3、阿昔洛韦：静滴速度过快或剂量过大可出现血尿素氮，肌酐升高，肾功能不全者需注意。
4、更昔洛韦：靶目标是疱疹病毒类的病毒，主要是巨细胞病毒，是儿童人巨细胞毒严重感染的一线用药。但口服吸收差，毒副作用主要为白细胞抑制作用，故需每3~5天要查一次外周血象。
5、膦甲酸钠：可抑制病毒DNA多聚酶。但有30%的药物沉积于骨，牙和软骨中，有肾毒性，可产生肾功能不全，所以临床上限于极严重的病例使用。
6、西多福韦：抑制病毒DNA多聚酶。半衰期长是其优势，但常见粒细胞减少和不可逆的剂量依赖性肾毒性。
7、阿糖胞苷，阿糖腺苷：有致畸，致癌可疑。
8、奥司他韦：副反应有恶心，呕吐，但少见。
9、感康（复方氨酚烷胺)：用量过大可致中枢症状。中枢神经系统疾病或动脉硬化者慎用。癫痫，精神病患者，孕妇，哺乳妇女忌用。可有胃肠不适，失眠或兴奋，共济失调，眩晕。
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