小儿脑干脑炎一般是病毒性脑炎，发病急骤，病情凶险。脑干是人的生命中枢，维持心跳、呼吸、消化、体温、睡眠等重要生理功能。病毒性脑炎一般是降颅压、对症支持治疗，小儿突发脑干病变常会抢救不及而导致死亡。
脑干脑炎病症的严重程度，差别很大，轻度脑炎的症状跟任何病毒感染相同：头痛、发热、体力衰弱、没有食欲。较严重的脑干脑炎症状，造成心烦气躁、不安及嗜睡，最严重的症状是臂部或腿部肌肉无力，双重视觉言语及听觉困难，有些病例的嗜睡现象，会转变为昏迷不醒。
轻度脑干脑炎很常见，甚至会不为人所察觉。但在一千个麻疹病例中，大约会有一个引发轻度脑干脑炎。
婴儿及老年人患脑干脑炎可能会致命，但其他年龄的人患脑干脑炎则可能会完全复原，有时候是在经过长时间患重病之后复原。虽然脑干脑炎可能造成脑的永久性损害，但产生严重后果的百分比却不高。
一般治疗小儿脑炎患者应住院治疗.住院后严密观察神志变化，注意体温，脉搏，呼吸和血压的改变.随时注意瞳孔大小.一旦发生改变，即应进行对症处理.注意营养及热量补充，昏迷病人可予鼻饲.保持皮肤清洁干燥，防止发生褥疮.保持口腔清洁。
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