巧克力与牙齿的关系，就一般常识判断，除了满足一时的口腹之欲外，剩下的大概就是“甜食与蛀牙”这层因果关系了。科学家发现，巧克力除了好吃之外，竟然还具有预防蛀牙的神奇功效。
这项新发现是由日本大阪大学的研究人员所提出，他们在制造巧克力的可可豆中发现了一种抗菌成分，能够中和巧克力的糖份，进而降低蛀牙率。
研究人员指出，这种抗菌成分大多存在于可可豆壳，但位于可可豆外围的可可豆壳却往往遭到丢弃。研究人员相信，如果将可可豆壳加以提炼萃取，应可加进漱口药水或是牙膏当中，可以防止蛀牙。
龋齿的主要成因是牙菌斑，而链球菌Streptococcus mutans（缩写：S。 mutans）则是引发人类龋齿的主要病原菌。S。 mutans会产生一种附着在牙齿表面的酵素，将食物中的蔗糖形成不溶于水的葡萄糖聚合物，使得病原菌附着在牙齿上形成牙菌斑，而牙菌斑中的细菌则会将糖转换成酸性物质，进而吞噬牙齿的珐琅质。
大阪大学的研究人员先是把可可豆壳的萃取物加进S。 mutans的培养皿中，结果发现居然成功地阻绝了葡萄糖聚合物的形成。接来来研究人员就进一步针对老鼠进行测试，并在“实验组”老鼠的饮用水中添加可可豆壳萃取物，结果3个月后发现，同样被喂食高含糖量食物的两组老鼠，没有添加可可豆壳萃取物的“对照组”老鼠中平均有14个蛀洞，但“实验组”老鼠则不超过6个。
负责主持这项研究的大岛武向《新科学家》杂志表示，“未来可可豆壳的萃取物可能可以被加进漱口药水或牙膏中”。大岛还说，这类物质也可以添加在巧克力食品中，以保护牙齿健康。
伦敦“Guy‘s，King’s and St Thomas‘s牙医研究所”的拜顿医师表示，其实类似可可豆壳萃取物这类物质在其它植物中也找得到，而它们也确有功效，但拜顿认为，与其吃巧克力，还不如保持口腔清洁卫生，才是维持牙齿健康的最佳途径。
“英国牙医学会”（British Dental Association）发言人表示，“如果巧克力当真有助于减少龋齿，那当然是一件好事，但你也必须记住巧克力是一种含糖食品。我们的建议还是跟以前一样：如果人们想吃（喝）含糖的甜食或饮料，那么他们就应该限制自己只在进餐时间食（饮）用，并且定时向牙医师报到”。
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